BM48-31病毒
外观
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BM48-31病毒![]() | |
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病毒分类 ![]() | |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus |
亚属: | SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus |
种: | 严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒 SARSr-CoV
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毒株: | BM48-31病毒 BM48-31
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BM48-31病毒(BtCoV/BM48-31/Rhi bla/Bulgaria/2008;BM48–31/BGR/2008)是严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒(SARSr-CoV)的一个病毒株,在保加利亚布腊氏菊头蝠的粪便样本中发现,其基因组已被完整定序,于2010年发表[1]。
发现
[编辑]2008年,研究人员在保加利亚各地采集蝙蝠粪便样本,经序列分析后发现多种冠状病毒病毒株,其中属于SARSr-CoV的可分为两支,一支皆感染地中海菊头蝠,另一支则包含感染布腊氏菊头蝠、马铁菊头蝠与西班牙菊头蝠的病毒株,有一布腊氏菊头蝠的病毒株被完整定序,即为BM48-31病毒[1]。
BM48-31病毒的基因组长29276nt[2],与其他SARSr-CoV相较之下,此病毒株缺乏ORF8(2019年发表的肯亚BtKY72病毒亦不具有ORF8[3]),另外此病毒株的ORF3b和其他蝙蝠SARSr-CoV的一样比SARS病毒的短,不过相较于Rf1等蝙蝠病毒ORF3b胺基酸序列和SARS病毒的相似度超过90%,BM48-31病毒ORF3a胺基酸序列和SARS病毒的相似度仅有约45%[1]。
分类
[编辑]种系发生学研究结果显示BM48-31病毒与BtKY72病毒组成一个演化支,两者基因组序列相似度为81%[3],此演化支是SARSr-CoV演化树的基群,与其他SARSr-CoV分家早于SARS-CoV和SARS-CoV-2分家的时间[4][5]。
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参考文献
[编辑]- ^ 1.0 1.1 1.2 Drexler JF, Gloza-Rausch F, Glende J, Corman VM, Muth D, Goettsche M; et al. Genomic characterization of severe acute respiratory syndrome-related coronavirus in European bats and classification of coronaviruses based on partial RNA-dependent RNA polymerase gene sequences.. J Virol. 2010, 84 (21): 11336–49. PMC 2953168
. PMID 20686038. doi:10.1128/JVI.00650-10.
- ^ Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008, complete genome. NCBI. [2021-02-21]. (原始内容存档于2022-03-29).
- ^ 3.0 3.1 Tao Y, Tong S. Complete Genome Sequence of a Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Coronavirus from Kenyan Bats.. Microbiol Resour Announc. 2019, 8 (28). PMC 6624766
. PMID 31296683. doi:10.1128/MRA.00548-19.
- ^ Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H; et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding.. Lancet. 2020, 395 (10224): 565–574. PMC 7159086
. PMID 32007145. doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8.
- ^ Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2.. Nat Microbiol. 2020, 5 (4): 536–544. PMC 7095448
. PMID 32123347. doi:10.1038/s41564-020-0695-z.
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